2023年2月27日，国际著名期刊《Medical Image Analysis》（中科院1区Top期刊，IF：13.828）以研究论文的形式在线发表了beat365平台官方网站高文朋课题组的题为“Surface deformation tracking in monocular laparoscopic video”的研究文章，该研究提出基于分段仿射变换模型（PADM）的单目内窥镜视频中软组织形变追踪的方法，实现单目内窥镜下实时准确的软组织区域形变追踪。该课题组长期关注医学影像分析、计算机辅助手术和手术机器人研究，在微创手术机器人智能感知方向开展了大量研究工作。术中视觉辅助技术可以提高微创手术的准确性和安全性。本研究中基于PADM的非线性形变软组织表面追踪方法，通过马尔科夫随机场生成mask优化运动场一致性、局部纹理连续性和局部纹理残差，最大程度利用时空信息消除追踪异常对模型整体性能的影响；引入时序形变固化机制抑制追踪失败时模型形变场的退化。实验结果表明该方法对于弱纹理、烟雾及手术器械遮挡情况下均具有很好的鲁棒性。该研究成果未来将集成到微创手术机器人系统中，既可以为医生提供术中实时手术禁区范

​2023年2月21日，我院田维明课题组研究揭示了Krüppel样转录因子7（Klf7）调控心脏糖脂代谢平衡参与心肌肥厚发病的新机制。

2023年2月9日，我院杨帆课题组与合作者在Nature Communications上发表题为Two distinct binding modes provide the RNA-binding protein RbFox with extraordinary sequence specificity的研究成果。研究首次揭示了RNA结合蛋白RbFox通过运用在功能及结构上的两种不同的RNA结合模式来实现其非凡的RNA序列选择性（一种模式以高亲和力特异识别同源RNA底物；另一种模式通过热力学惩罚来容纳所有其他非同源RNA底物）。本研究工作在理解RNA与RBP相互作用的多样性及复杂调控功能方面提供了全新的启示。明确RBP对RNA底物特异性选择的分子机制，对于理解RNA生物学和制定针对RNA相关疾病的治疗策略至关重要。对于RbFox这种仅具有单一RNA结合模块的RBP来说，使用截然不同的结合模式来实现高序列选择性，还是一个新颖的概念。更有趣的是，核磁解析的复合物溶液结构显示RbFox的两种模式不仅在RNA结合界面呈现很大的构象差别，更在RNA结合位点的远端出现了显著的构象重排。这个结果提示

2023年2月7日，国际著名期刊《Cell Death Differentiation》以研究论文的形式在线发表了beat365平台官方网站李钰教授课题组的题为“The regulation loop of MARVELD1 interacting with PARP1 in DNA damage response maintains genome stability and promotes therapy resistance of cancer cells”的研究文章。该研究发现，细胞稳态调控因子MARVELD1与PARP1相互作用介导DNA损伤响应，促进维持基因组稳定性并影响基于DNA损伤的抗肿瘤治疗疗效。此课题组长期关注细胞稳态维持与DNA损伤响应调控。细胞稳态维持在抑制肿瘤发生发展和影响肿瘤治疗疗效中扮演“双刃剑”的角色，DNA损伤响应系统在恶性肿瘤的预防和治疗中具有关键作用，既往研究显示在应激条件下，MARVELD1参与细胞内稳态的维持。PARP1作为重要的感受器分子在DNA损伤响应中介导多条信号通路，已成为肿瘤治疗的新靶点，阐明PARP1的调控因素有助于更全面地了解肿瘤发生和

2022年11月18日，我院杨帆课题组在Nature Communications上发表题为A redox switch regulates the assembly and anti-CRISPR activity of AcrIIC1的研究成果。该研究首次发现NmeAcrIIC1存在由两个保守半胱氨酸介导的氧化还原开关，该开关通过调节AcrIIC1单体-二聚体的氧化还原循环，来动态调控其对Cas9的抑制活性。基于新发现，研究人员进一步设计并获得在高活性氧细胞环境内具有高效抑制Cas9活性的AcrIIC1突变体蛋白，为降低CRISPR基因编辑脱靶效应的分子设计提供了新思路。 Anti-CRISPRs（Acrs）是噬菌体作为抗击细菌CRISPR系统自卫机制进化而来的一类重要调控蛋白，通常由80-150个氨基酸组成。其可通过抑制靶DNA结合或切割，使CRISPR系统失活。Acrs是CRISPR-Cas系统的天然抑制剂，更是潜在的降低CRISPR基因编辑技术脱靶效应的强有力分子工具。然而，目前对于细胞内Acrs抑制CRISPR的这个重要生物过程动态调控的研究还相对比较薄弱。 作者首先通

2022年11月15日，胡颖教授研究团队在未折叠蛋白反应（UPR）介导的肿瘤细胞适应期向死亡期转换调控肿瘤耐药的分子机制研究中取得了重要进展。相关内容以研究论文的形式发表于《细胞死亡与分化》（Cell Death and Differentiation）（IF=12.067），论文题目为《抑制iASPP调控终末期UPR提高结直肠癌对BRAF抑制剂的敏感性》（iASPP suppression mediates terminal UPR and improves BRAF-inhibitor sensitivity of colon cancers）。肿瘤耐药是导致肿瘤患者治疗效果不佳的重要原因，由于其机制复杂，目前，直接通过靶向肿瘤耐药治疗肿瘤的效果并不理想，因此，明确肿瘤耐药的分子机制将为治疗肿瘤提供重要靶点。肿瘤细胞的基因突变、钙稳态失衡以及来自肿瘤微环境的低氧，氧化还原稳态失衡等多种生物学改变均可导致内质网中错误折叠蛋白的累积，从而破坏内质网稳态，导致内质网应激。在此应激压力作用下，肿瘤细胞可启动未折叠蛋白反应（Unfolded Protein Response，UPR）；UPR

2022年10月17日，我院蒋庆华课题组在英国牛津大学出版社《Nucleic Acids Research》期刊发表最新研究成果《DeepST: identifying spatial domains in spatial transcriptomics by deep learning》，提出了一种高精度的空间域（在基因表达和组织形态学上具有相似性的区域）识别算法DeepST，它是一种基于深度学习的网络集成算法，通过在大量不同分辨率的空间转录组学数据集上进行测试，显示DeepST的空间域识别性能优于已经公开发表的空间域识别方法。1 简介复杂组织的功能与不同细胞类型的空间分布有关。组织中转录表达的相对位置对于了解其生物学功能至关重要。空间转录组学（ST）的突破性技术，如10× Visium、Slideseq和Stereoseq，已经能够在捕获位置（称为斑点）以几个细胞甚至亚细胞水平的分辨率对基因表达进行全基因组分析。识别空间域（即在基因表达和组织学上具有相似性的一个区域）是空间转录组学研究中面临的巨大挑战之一。目前，识别空间域的方法主要分为两类：非空间聚类方法和空间聚类方法。传统的非空

2022年10月8日，田维明教授团队以“klf7通过调控clock基因导致klf7杂合敲除小鼠出现自闭样行为”为题，在Cell Bioscience（IF 9.5835）上发表研究论文，该研究发现klf7可以调控生物钟核心基因clock，并同时扰乱其下游其它节律基因的表达，使昼夜节律系统产生震荡。同时，klf7缺失小鼠表现出了明显的自闭症样行为，经节律调节药物褪黑素治疗后，小鼠的节律系统获得了一定的恢复，自闭样行为也得到了缓解。因为，该工作认为klf7是通过调控生物钟基因clock导致自闭症的发生。Klf7被认为是一个自闭易感基因，但是发病机制并不清楚。研究人员发现klf7是维持视交叉上核正常功能的一个重要调节因子，视交叉上核是哺乳动物脑内昼夜节律起搏器，调节身体内各种昼夜节律活动。Klf7的缺失必将影响视交叉上核的功能从而引发节律系统的震荡，而紊乱的昼夜节律和自闭症之间有着很强的关联。因此，klf7很有可能是通过扰乱昼夜节律导致了自闭症的发生。田维明教授为本研究的通讯作者，博士研究生田辉、硕士研究生矫彦文为第一作者，该项研究得到了国家自然科学基金委经费的支持。 论文链接：http: